玉溪農業職業技術學院的前身是國家級重點中專玉溪農業學校，學校成立于1956年，1991年經省教委評估認定為“合格中專學校”；1993年被省政府認定為“省部級重點中專學校”，同年省政府批準建立“云南省玉溪煙草栽培學校”；1996年被省科委、團省委定為“云南省青年星火技術培訓示范基地”，并獲云南省農業中專教學規范化管理一等獎；1997年省教委命名為“省級文明學校”；1998年被省委、省政府命名為“省級文明單位”；1999年被省委、省政府命名為“文明單位工作先進單位”；2000年首批步入國家級重點中專行列。于2002年3月22日經省政府批準，國家教育部備案，成立以舉辦高等職業技術教育為主、面向全國招生的普通全日制公辦高等職業學校（即玉溪農業職業技術學院）。校園占地面積166.11畝，建筑面積68110.53m2；建有15個實驗室和科技園、養殖場、農場等實驗實習場所及34個校外實習基地；圖書館現有藏書10萬多冊；擁有700多臺微機，建立了主干千兆校園網，通過寬帶與國際互聯網對接，校園建有標準田徑運動場1塊，籃球場4塊，排球場2塊，小型足球場3塊，學校固定資產達4418萬元。

學院擁有一支愛崗敬業、專業技能熟練、教學經驗豐富的師資隊伍。現有在職教職工192人。專業技術人員中有副教授25人，高級講師5人；有72人具有中級專業技術職稱。近年來，有32名教師獲得碩士學位，1名教師被評為“全國優秀教師”，有5名教師獲得省級優秀教師、優秀教育工作者的榮譽稱號，先后10項科技成果獲得了市級以上科技成果獎，編著出版教材22部;2005年在省級以上刊物發表論文45篇。現學院聘請外籍教師三人，開設了英語提高、韓語、傣語等課程。