包頭醫學院成立于1958年，是新中國在少數民族地區較早建立的一所普通高等醫學院校，建校伊始即招收本科學生，學制5年。1959年和1961年，包頭市衛生學校和內蒙古衛生干部進修學院先后并入包頭醫學院。1965年，改為包頭醫學專科學校，1977年恢復包頭醫學院。2003年包頭醫學院與包頭鋼鐵學院、包頭師范學院合并成立內蒙古科技大學，2004年12月內蒙古自治區人民政府批準內蒙古科技大學分為三個具有獨立法人資格的辦學實體，原包頭醫學院更名為內蒙古科技大學包頭醫學院。

經過59年曲折發展歷程，學校秉承“團結、敬業、求實、創新”的校訓，弘揚“艱苦奮斗、自強不息、勤儉奉獻”的精神，已形成集全日制本科教育、研究生教育、繼續教育、職業教育為一體，以醫學為主，醫學、管理學、文學、法學、理學、教育學多學科協調發展的多層次、多形式的辦學格局和學科體系。1997年通過原國家教委本科教學工作合格評價，2008年在教育部本科教學工作水平評估中被評為“優秀”。

學校坐落于世界聞名的稀土之鄉、草原鋼城、首批全國文明城市――內蒙古自治區包頭市，占地面積67萬平方米，建筑面積26.5萬平方米。教學科研設備總值8746.22萬元，館藏圖書90余萬冊。

學校設置17個二級學院。自1980年開始招收碩士研究生，1986年獲得碩士學位授權資格。現有4個碩士學位授權一級學科，4個碩士專業學位授權一級學科，2個碩士學位授權二級學科。設有19個本科專業，其中國家級特色專業建設點1個，教育部本科專業綜合改革試點1個，教育部臨床重點建設專科1個，教育部卓越醫生教育培養計劃項目1個，自治區級品牌專業6個，自治區級重點建設專業2個。自治區級實驗教學示范中心4個，自治區優質精品課程2門、精品課程25門。

學校有教職工800名，其中高級職稱227名；具有博士學歷及在讀博士94人，碩士研究生學歷351人；有博士研究生導師3名，碩士研究生導師318名。享受“國務院特殊津貼”專家17人，自治區“有突出貢獻的專家”12人，包頭市政府特貼專家1人。入選自治區“草原英才”創新創業人才團隊7個，“草原英才”工程10人，內蒙古青年創新人才1人，自治區“新世紀321人才工程”第一、第二層次20人，包頭市拔尖人才6人，“鹿城英才”13人，包頭市“5512”領軍人才26人。自治區高等學校教學名師9名，自治區高等學校教壇新秀7名。自治區級教學團隊9個。

學校面向全國16個省、市、自治區招生。現有全日制在校學生9589人，其中碩士研究生425人、本專科生9164人。建校以來，為國家培養輸送了6.5萬余名合格醫學人才。

現有2個自治區領先學科，7個自治區重點學科，2個自治區重點培育學科。建有自治區級重點實驗室4個，自治區醫療衛生系統重點實驗室3個，自治區工程技術研究中心3個，包頭市和內蒙古自治區兩級院士專家工作站4個。內蒙古自治區基因診斷研究所、應用解剖研究所、內蒙古自治區全科醫學培訓中心、內蒙古學校衛生人員培訓基地等研究培訓機構設在我校。

學校有2所直屬附屬醫院，13所非直屬附屬醫院，31所臨床教學實習醫院,有公共衛生、藥學、法醫學等專業教學基地125個。

學校積極開展國內外交流與合作。與澳大利亞拉籌伯大學、英國皇家英格蘭外科學院、蒙古國國立醫科大學建立合作關系。

當前，在全面建成小康社會的歷史進程中，包頭醫學院貫徹五大發展理念，以培養德智體美全面發展的高素質應用型人才為目標，全面提高教學質量，勵精圖治，奮發有為，為祖國北疆亮麗風景線培養更多更好的健康衛士和多樣人才而不懈努力！