院系專業

根據2014年9月學校官網顯示，學校本部設有中醫臨床學院、藥學院、針灸推拿學院、中西醫結合學院、臨床醫學院、護理學院、基礎醫學院、公共衛生學院、醫學技術學院、信息工程學院、經貿與管理學院、人文與社會科學學院、繼續教育學院、藏醫學院、附屬醫院臨床教學部、理科教學部、外語教學部、體育藝術課部等18個教學院（部），另有甘肅中醫學院第一附屬醫院、甘肅中醫學院附屬醫院2個附屬醫院，有20個本科專業。

專業設置

公共衛生學院 預防醫學（五年制本科）

信息工程學院 醫學信息工程（四年制本科）

人文與社會科學學院 應用心理學（醫學心理學方向、四年制本科）

醫學技術學院 醫學影像學（五年制本科）、醫學檢驗技術（四年制本科）

藏醫學院 藏醫學（五年制本科）、藏藥學（四年制本科）

經貿與管理學院 公共事業管理（醫藥衛生方向、四年制本科）、國際經濟與貿易（中醫藥方向、四年制本科）

護理學院 護理學（四年制本科）

藥學院 中藥學（四年制本科）、藥物制劑（四年制本科）、中草藥栽培與鑒定（四年制本科）、中藥資源與開發（四年制本科）

針灸推拿學院 針灸推拿學（五年制本科）、康復治療學（四年制本科）

中西醫結合學院 中西醫臨床醫學（五年制本科）

臨床醫學院 臨床醫學（五年制本科）

中醫臨床學院 中醫學（五年制本科）、中醫學（骨傷科學方向、五年制本科